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按照能否被微生物快速利用分类快速碳源：来的快，去的也快的碳源，能较快被微生物利用，如葡萄糖、当地红糖、同城蜂蜜等。微生物能迅速吸收这些物质，进行细胞代谢和生长繁殖活动。缓释碳源或长效碳源：作用缓慢但持续时间较长的碳源。像淀粉、附近谷物粉、当地小米粉等大分子有机物属于此类。由于一些微生物不能直接利用大分子物质，需要先把它们分解成小分子才能被其他微生物利用，这个分解过程消耗能量，所以其作用发挥相对缓慢.（三）按照生产方式分类发酵碳源：通过发酵的方式获得的碳源。例如利用生物工程原理，对糖类、当地农产品废料等发酵生产出的生物质碳源。普通碳源（或传统碳源）：包括化学合成碳源、本地提取碳源和纯化碳源，如一些化工合成的小分子有机酸、醇类或者直接从自然资源中提取和纯化得到的单一有效成分的碳源等。
在污水处理方面的作用调节污水碳氮比（C/N）促进脱氮反应：在生化法脱氮工艺中，污水中的C/N比对于总氮去除效率影响很大。当C/N比不合适（通常是C/N过小，即碳源不足）时，添加碳源能重新将C/N调整到合适范围，对于提高生化处理系统中反硝化菌的活性、进而污水的脱氮效率至关重要。因为反硝化菌需要以碳源作为底物来进行反硝化作用，将硝酸盐氮还原为氮气逸出水体从而去除总氮。不同的碳源对反硝化效率影响也有所不同，如甲醇作为外碳源用于污水处理时，当甲醇充足时，反硝化速率较快；乙酸钠由于是小分子有机酸盐，反硝化菌易于利用，在合适的碳氮比（比如碳氮比4.6时）下能达到稳定的脱氮效果；生物质碳源因为主要组分易于被微生物利用，也有助于污水的脱氮过程。提高污泥活性、同城处理效果：碳源可以维持和提高污泥活性，进而整个污水处理系统对污水中各类污染物的去除效果。例如在活性污泥法处理污水过程中，污泥中含有大量的微生物，这些微生物需要碳源来生长和繁殖，如果污水中的碳源不足，污泥中的微生物活性降低，分解污染物的能力相应下降，而补充合适的碳源能够恢复甚至提高污泥对污染物的去除能力，使污水的处理更加，像是在去除污水中的有机物、磷元素等方面都会有正向影响。
用于微生物的繁殖与生长；微生物在污水的生物处理过程中至关重要，而碳源是微生物所需的营养来源。污水中本身可能含有一定量的有机物质，但在许多污水处理场景中，这些有机物质往往不能满足微生物快速繁殖和生长的需求。尤其是在污水处理系统的调试末期，需要对微生物进行培养、同城收集和驯化，这个时候微生物需要大量的碳源来保持快速增长。例如在新建的污水处理厂开始运营时，活性污泥的培养过程需要添加碳源。此外，在一些工业废水处理中，废水的成分可能比较特殊，其中的有机物可能很复杂或者浓度较低，无法为微生物提供足够的碳源，这时候人为投加碳源就显得非常必要。比如一些化工废水，可能含有大量的难降解有机物，但微生物可利用的碳源物质很少，此时投加合适的碳源，如甲醇、同城葡萄糖等，可以为微生物提供生长所需的能量和物质，促进微生物大量繁殖以及活性的，从而有效地开始对污水中的污染物进行分解代谢。
